拓普塞斯(在线咨询),测序仪,3130测序仪

3730测序仪优势
  北京拓普塞斯生物技术有限公司成立于 2008 年,是湖北三七七生物技术有限公司的全资子公司,我司自成立至今始终致力于各种类型的生物学仪器的销售、维修维护等服务。如测序仪、合成仪、扩增仪、蛋白纯化仪、自动工作站和气相色谱质谱联用仪等,公司尤其在 abi 各种型号的基因分析仪方面有丰富的维修维护经验。
? 大大提升您实验室的分析能力
显著改善的数据质量,大大降低的单一样品分析成本使您每天可以分析更多的样品。 全自动的3730基因分析系统在极大提升您的实验室分析能力的同时也使您节约研究经费。这意味着您可以进行更多的激动人心的研究项目。 (您也可以随时升级到96道毛细管的3730xl 基因分析仪)
? 将您的基因分析工作流程化自动化
3730 基因分析仪的设计目标是高度可靠,48小时无人监管操作(仪器初始设置的时间可以在30分钟内完成)一体化的样品板架,内置条形码扫描装置和仪器上的自动化灌胶系统:这一些列的自动化的仪器操作设计使操作人员的关注时间大大降低,同时也使人工误操作的机会大大减少。
? 大大提高数据的产率
即使您使用低浓度样品和高倍稀释的测序试剂,提高的信噪比也可保证了您获得高质量的分析结果 大大节省劳动力的自动化设计使关注仪器的时间和手工操作的时间大大减少,可以使您更有效地分析更多
北京拓普塞斯生物专注测序仪销售与维修服务,主营产品型号:有373测序仪、377测序仪、310测序仪、3700测序仪和3100测序仪型等dna测序仪。欢迎您致电联系我们获取更多优惠~~~
测序仪之pcr测序反应
  北京拓普塞斯生物技术有限公司成立于 2008 年,是湖北三七七生物技术有限公司的全资子公司,我司自成立至今始终致力于各种类型的生物学仪器的销售、维修维护等服务。如测序仪、合成仪、扩增仪、蛋白纯化仪、自动工作站和气相色谱质谱联用仪等,公司尤其在 abi 各种型号的基因分析仪方面有丰富的维修维护经验。
pcr测序反应(1) 取0.2ml的pcr管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:所加试剂 测定模板管 标准对照管bigdye mix 1μl 1μl待测的质粒dna 1μl -pgem-3zf (+) 双链dna - 1μl待测dna的正向引物 1μl -m13(-21)引物 - 1μl灭菌去离子水 2μl 2μl总反应体积5μl,不加轻矿物油或石蜡油,盖紧pcr管,用手指弹管混匀,稍离心。(2) 将pcr管置于9600或2400型pcr仪上进行扩增。98℃变性2min后进行pcr循环,pcr循环参数为96℃ 10s,50℃ 5s,60℃4min,25个循环,扩增结束后设置4℃保温。
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二代测序仪的操作流程
  北京拓普塞斯生物技术有限公司成立于 2008 年,是湖北三七七生物技术有限公司的全资子公司,我司自成立至今始终致力于各种类型的生物学仪器的销售、维修维护等服务。如测序仪、合成仪、扩增仪、蛋白纯化仪、自动工作站和气相色谱质谱联用仪等,公司尤其在 abi 各种型号的基因分析仪方面有丰富的维修维护经验。
1)测序文库的构建(library construction)
  首先准备基因组dna(虽然测序公司要求样品量要达到200ng,但是gnome analyzer系统所需的样品量可低至100ng,能应用在很多样品有限的实验中),然后将dna随机片段化成几百碱基或更短的小片段,并在两头加上特定的接头(adaptor)。如果是转录组测序,则文库的构建要相对麻烦些,rna片段化之后需反转成cdna,然后加上接头,或者先将rna反转成cdna,然后再片段化并加上接头。片段的大小(insert size)对于后面的数据分析有影响,可根据需要来选择。对于基因组测序来说,通常会选择几种不同的insert size,以便在组装(assembly)的时候获得更多的信息。
  2)锚定桥接(surface attachment and bridge amplification)
  solexa测序的反应在叫做flow cell的玻璃管中进行,flow cell又被细分成8个lane,每个lane的内表面有无数的被固定的单链接头。上述步骤得到的带接头的dna 片段变性成单链后与测序通道上的接头引物结合形成桥状结构,以供后续的预扩增使用。
  3)预扩增(denaturation and complete amplification)
  添加未标记的dntp 和普通taq 酶进行固相桥式pcr 扩增,单链桥型待测片段被扩增成为双链桥型片段。通过变性,释放出互补的单链,锚定到附近的固相表面。通过不断循环,将会在flow cell 的固相表面上获得上百万条成簇分布的双链待测片段。
  4)单碱基延伸测序(single base extension and sequencing)
  在测序的flow cell中加入四种荧光标记的dntp 、dna 聚合酶以及接头引物进行扩增,在每一个测序簇延伸互补链时,每加入一个被荧光标记的dntp就能释放出相对应的荧光,测序仪通过捕获荧光信号,并通过计算机软件将光信号转化为测序峰,从而获得待测片段的序列信息。从荧光信号获取待测片段的序列信息的过程叫做base calling,illumina公司base calling所用的软件是illumina’s genome analyzer sequencing control software and pipeline analysis software。读长会受到多个引起信号衰减的因素所影响,如荧光标记的不完全切割。随着读长的增加,错误率也会随之上升。
  5)数据分析(data analyzing)
  这一步严格来讲不能算作测序操作流程的一部分,但是只有通过这一步前面的工作才显得有意义。测序得到的原始数据是长度只有几十个碱基的序列,要通过生物信息学工具将这些短的序列组装成长的contigs甚至是整个基因组的框架,或者把这些序列比对到已有的基因组或者相近物种基因组序列上,并进一步分析得到有生物学意义的结果。
北京拓普塞斯生物专注测序仪销售与维修服务,主营产品型号:有373测序仪、377测序仪、310测序仪、3700测序仪和3100测序仪型等dna测序仪。

北京拓普塞斯生物技术有限公司

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